Alguma coisa terá de inverter o circuito.
1- Se o controlo for manual, um simples inversor fará isso
2- O controle automático vai depender sempre de uma condição, ( Sinal de um sensor, 1 ou 0 de uma porta lógica, etc etc).
Em ambos os casos a alimentação do motor (ventilador neste caso) pode ser comutada com um tiristor ou transistor ou dois, depende da alimentação e do tipo de alimentação.
Basicamente a ideia é que o ventilador trabalha em tensão e, se por exemplo, a tensão de funcionamento for 5V e tivermos uma fonte de +5 0 -5, basta comutar os +5 pelos -5, isto é apenas uma das opções possíveis, neste caso até podemos usar um relé que facilmente comutará.
Com apenas um relé, pode mesmo com tensão positiva comutador automaticamente os dois polos, apenas com um impulso na bobina do relé.
Existe uma série de possibilidades, incluindo o uso de um CI de motor Step by Step, tudo depende da aplicação e da alimentação.