Amigo mario1970,
Grato pela explicação mais detalhada. Eu tentarei dar umas dicas baseadas naquilo que eu sei de electrónica, e não na experiência que tenha em reparações de TV, daí que espero não dizer nenhum "disparate"
Ora vejamos, de inicio os componentes avariados, impossibilitavam a disponibilidade de 3.3V no circuito, o que quer dizer que o pino 49 do IC401 nunca era puxado a +3.3V (via R469) o que faria com que a TV nunca entrasse em stand-by - faz sentido.
Se a TV não tem R111, R120 e C108, então o pino 9 do varicap também não é necessário neste chassi.
As voltagens que indica para R406, não me espanta, afinal é uma resistência de 1M. Ao tentar fazer uma sintonia, estes valores devem variar ... mas só conseguirá ter uma ideia do que está a acontecer com um osciloscópio.
Segundo a sua descrição, o que mais me intriga é ter 0V no pino 4 do varicap com a tv ligada. Isto não me faz sentido, porque significa que não existe sinal de clock para a comunicação I2C, com um multímetro, também deveria aqui registar 5V (apesar de neste caso ser uma onda quadrada, com uma frequência de 100KHz ... digo isto, porque sendo este chassi algo antigo, este era o valor standart quando este barramento começou a ser usado, mas pode ser uma frequência mais elevada - o valor não é relevante neste caso). Veja se neste pino tem uma resistência baixa para GND, mesmo com a TV desligada. Na dúvida troque C412, e diga se algo mudou ?
Verifique também R429 e R436, que são as resistências na linha de comunicação entre o micro e a EEPROM.
Abraço