Terá de ser mais preciso...
1. No caso de sistemas controlados por software, seja de que tipo for, o problema pode estar no software ou no hardware.
2. Se o problema está no controlo(uma vez que ambos os motores funcionam embora no mesmo sentido, se bem entendi), eu verificaria primeiro o software de contolo.
Não terá feito alguma alteração e só gravou posteriormente?
Já tentou fazer o envio novamente do software?
Em alguns casos já verifiquei maus funcionamentos por causa do software, alguns nem percebi bem porque começou a funcionar mal. Faça o upload novamente.