Não vejo vantagem nenhuma pelo contrário.
O raspberry funciona com qualquer linguagem com a inclusão de um interface entre o hardware e o software, as libs (bibliotecas). A consola é redutora, há funções e possibilidades que ficam limitadas. O IDE do arduino é uma subcategoria da linguagem C que é instalada por defeito no raspberry.
O php (a linguagem de programação mais usada na internet) interpreta o hardware como um ficheiro, pode ler esse hardware ou escrever no hardware. mas, para quem esteja familiarizado com o arduino, pode usar o wiring PI.
Estas são as linguagens mais usadas no Raspberry e algumas no Arduino
Programar o Raspberry